Kansallisten tukien tavoitteena on täydentää EU:n yhteisen maatalouspolitiikan mukaisia tukimuotoja, turvata maatalouden toimintaedellytykset eri tuotantosuunnissa ja eri alueilla sekä edesauttaa maaseudun elinvoimaisuuden säilymistä. Kansallisia tukia maksetaan peltokasvituotannon ja puutarhatuotannon lisäksi myös kotieläintuotannolle.

Kansallinen tukijärjestelmä muodostuu kahdesta päätukimuodosta, jotka ovat Etelä-Suomen kansallinen tuki (perustuu artiklaan 141) sekä Keski- ja Pohjois-Suomessa maksettava pohjoinen tuki (perustuu artiklaan 142). Tämän lisäksi maksetaan myös eräitä muita kansallisia tukia, kuten perunantuotannon ja sokerijuurikkaan kansallisia tukia sekä ympäristötuen kansallista lisäosaa.